Las materias que comprende el archivo tratan preferentemente de: Movimiento de naves, visitas de fondeos o irregularidades ocurridas a bordo de las embarcaciones, solicitudes de zarpe y arribo, solicitudes de conseciones de terrenos de playas, conseciones marítimas, concesiones para los pescadores, memorias anuales, información sobre obreros marítimos de bahía, listado de pasajeros y comunicaciones desde y hacia la Capitanía.